Melanotan-II je slabo rastvorljiv u vodi, ali pokazuje dobru rastvorljivost u organskim rastvaračima kao što su dimetil sulfoksid (DMSO) i N,N-dimetilformamid (DMF).

U praktičnim primjenama, ako je otapanje potrebno u eksperimentalne ili terapeutske svrhe, ono se prvo može otopiti u DMSO-u kako bi se pripremio osnovni rastvor visoke-koncentracije, a zatim razrijeđen odgovarajućim puferom (kao što je fiziološka otopina ili fiziološka otopina puferirana sa fosfatom{1}}). Međutim, mora se voditi računa o kontroli konačne koncentracije DMSO-uglavnom održavajući je ispod 0,1%-kako bi se izbjegli toksični efekti na ćelije ili organizam.

U oblasti estetike, Melanotan-II je privukao široku pažnju zbog svoje sposobnosti da indukuje proizvodnju melanina i potamni kožu. Brojne studije su se fokusirale na procjenu njegove učinkovitosti i sigurnosti u pogledu zaštite od sunca i kozmetičke upotrebe.